Το πρωτάθλημα της περιόδου 2017–18 ήταν η 38η διοργάνωση πρωταθλήματος ποδοσφαίρου της ΕΠΣ Κυκλάδων. Πρωταθλήτρια αναδείχθηκε η Α.Σ. Θύελλα Καμαρίου, η οποία κέρδισε την άνοδο στη Γ΄ Εθνική ερασιτεχνική κατηγορία.
Ο θεσμός του κυπέλλου διοργανώθηκε για 36η φορά και αποτέλεσε ταυτόχρονα την πρώτη φάση του Κυπέλλου Ερασιτεχνών 2017-18 της ΕΠΟ. Κυπελλούχος αναδείχθηκε η Θύελλα Καμαρίου, η οποία απέκτησε το δικαίωμα συμμετοχής στο Κύπελλο Ερασιτεχνών.[1]
Για την Α' Φάση[2], οι 22 σύλλογοι χωρίστηκαν σε τρεις ομίλους με βάση τη γεωγραφική τους θέση, ώστε να ελαχιστοποιηθούν τα έξοδα των ομάδων για μετακινήσεις και διαμονή. Ο πρώτος όμιλος περιελάμβανε τις ομάδες από Μύκονο, Σύρο και Τήνο. Ο δεύτερος όμιλος τις ομάδες από Κύθνο, Μήλο, Πάρο, Σέριφο και Σίφνο. Τέλος, ο τρίτος όμιλος περιελάμβανε τις ομάδες από Θήρα, Ίο και Νάξο. Οι δύο πρώτες κάθε ομίλου, καθώς και οι τρίτες από τον 2ο και τον 3ο όμιλο προκρίθηκαν στη Β' φάση.
Ο Α.Σ. Πανσιφναϊκός δεν κατέβηκε να αγωνιστεί στο εκτός έδρας παιχνίδι με τον Α.Ο. Σερίφου, με αποτέλεσμα να ηττηθεί με 3-0 άνευ αγώνα, ενώ του επιβλήθηκε και ποινή αφαίρεσης 3 βαθμών.
Στη Β' φάση, οι 8 ομάδες που προκρίθηκαν, χωρίστηκαν σε δύο ομίλους με γεωγραφικά κριτήρια και οι πρώτοι κάθε ομίλου πήραν την πρόκριση για τον τελικό του πρωταθλήματος. Οι πρώτες ομάδες κάθε ομίλου της Α' φάσης ξεκίνησαν στη Β' φάση με μπόνους 3 επιπλέον βαθμούς, ενώ οι δεύτερες με μπόνους 1 επιπλέον βαθμό.
Ο Α.Ο. Σερίφου δεν κατέβηκε να αγωνιστεί στο εκτός έδρας παιχνίδι με τον Α.Ο. Μυκόνου την τελευταία αγωνιστική, με αποτέλεσμα να ηττηθεί με 3-0 άνευ αγώνα, ενώ του επιβλήθηκε και ποινή αφαίρεσης 3 βαθμών.
Ο Α.Ο. Λάβα δεν κατέβηκε να αγωνιστεί στα πρώτα παιχνίδια του μίνι τουρνουά, με αποτέλεσμα να ηττηθεί με 3-0 άνευ αγώνα, ενώ του επιβλήθηκε και ποινή αφαίρεσης 9 βαθμών. Στη συνέχεια αποχώρησε από το πρωτάθλημα και όλοι οι εναπομείναντες αγώνες του κατακυρώθηκαν στις αντίπαλες ομάδες με σκορ 3-0.
Στον θεσμό του κυπέλλου, πήραν μέρος τα σωματεία της Ε.Π.Σ. Κυκλάδων όλων των κατηγοριών και ο κυπελλούχος θα συμμετείχε στο Κύπελλο Ερασιτεχνών της σεζόν. Νικήτρια αναδείχθηκε για 1η φορά στην ιστορία της η Α.Σ. Θύελλα Καμαρίου, αφού κέρδισε στον τελικό τον Πανθηραϊκό με 4-3 στα πέναλτι.[3]